從前，一個求子心切的婦人，向神仙求助，獲神仙給予魔法大麥。大麥種在花樽後，立即長出花苞，婦人吻了花苞一下，花朵盛開，走出一個姆指般大的美麗姑娘，她因此被叫做「姆指姑娘」。
姆指姑娘本來在婦人家中快樂地生活，不過一天晚上，一隻蟾蜍媽媽跳進屋中，將姆指姑娘擄走，帶回河邊沼澤的巢穴，放在一塊荷葉上，準備給醜陋的兒子做新娘。
傷心的姆指姑娘哭起來，哭聲吸引到一群魚兒的注意。魚兒同情姆指姑娘的遭遇，於是咬斷荷葉的莖，讓她逃走。
荷葉載著姆指姑娘漂到遠方，一隻甲蟲飛過時見到姆指姑娘，抓起她帶到樹上，盛讚她的美麗。一班母甲蟲圍過來湊熱鬧，見到姆指姑娘時，批評她只有兩隻腳，沒有觸鬚，腰部纖幼，非常難看。
起初讚美姆指姑娘的甲蟲聽到，也覺得如此，便將姆指姑娘遺棄在樹林裏。
冬天來了，姆指姑娘又冷又餓，瀕死之際被田鼠婆婆收留。田鼠婆婆要姆指姑娘替她做家務以作回報，又自作主張，強逼姆指姑娘嫁給鄰居鼴鼠。田鼠婆婆說鼴鼠在地底擁有很多物業，嫁給鼴鼠會很幸福。
鼴鼠因為自己看不見，所以厭惡一切美麗的事物，但他喜歡姆指姑娘悅耳的歌聲，想將她關在不見天日的地底，一直陪伴他。
夏天過去，婚禮將要舉行，姆指姑娘站在家門前，哀愁地向太陽作最後道別，被一隻好心的燕子見到，讓姆指姑娘坐到他背上飛走。飛行途中，燕子被一個人類男人以箭射傷，姆指姑娘掉到泥地上昏迷，被男人拾回寓所。
姆指姑娘甦醒過來，發現身上衣衫被脫光，面前的男人正在對著自己自瀆。男人勃起的陰莖十分短小，只有姆指般大，但他將陰莖放近姆指姑娘，對比之下，自覺威武。
「女人就應該聽聽話話，我叫你去東就東，去西就西！」男人一邊用陰莖將姆指姑娘掃來掃去，一邊猙獰地說。「其他賤婦都看不起我，幸好讓我找到你呀。」
男人將姆指姑娘困在一個木盒中，每天拿她出來淫辱一番，不時要她抱著陰莖在桌子上彈跳。姆指姑娘受盡委屈，曾想過認命，直到男人有次用陰莖鞭打她，差點將她拍死後，她決意反抗男人的操控。
這天，男人如常地狎玩姆指姑娘，姆指姑娘待他勃起後，隨即跑回木盒，拿出一條黑色繩索，對準陰莖甩出繩套，牢牢索緊。男人痛極大叫，想抓住姆指姑娘，她卻垂繩降落地面，將繩尾綁在桌腳。
原來黑色繩索是由男人的陰毛編織而成，姆指姑娘花費很多時日，才採集到足夠的材料。
姆指姑娘趁著男人不能脫身，奔到牆邊，爬到窗台上，望到距離地面很遠，有點害怕，但她知道不能再留下，閉上眼睛往外一跳。姆指姑娘才剛墮下，忽然感到騰空而起，張開眼睛一看，自己正在乘著之前救過她的燕子上。
姆指姑娘被載到花之國度，遇到和她一樣大小的精靈王子，兩人愛上對方。精靈王子告訴姆指姑娘，他們都是同類，姆指姑娘在花之國度，可以做回自己。姆指姑娘被賦予一個新的名字，與精靈王子幸福地生活下去。
【給小朋友的話：一段愛情關係，難以完全對等，但完全不對等，卻是受難。有些人因為自卑情意結，要將伴侶不斷矮化，削弱其自尊，企圖完全操控對方。受害人千萬不要發展出愛情的斯德哥爾摩症候群，沉溺於被傷害，以為這樣就是自己的存在意義。決心離開，總會想到辦法。】
